در این آزمایشگاه جداسازی و شناسایی گیاهان مختلف در کنار بررسی خواص شیمیایی و دارویی آنها مورد مطالعه قرار می گیرد.

برخی از فعالیت های مهم انجام شده در این آزمایشگاه عبارتند از:
• اسانس گیری از بخش های مختلف گیاه بوسیله کلونجر
• عصاره گیری در حلال های مختلف (متانولی، اتانولی، آبی و ...)
• جداسازی و شناسایی اولیه فرکشن های بدست آمده از عصاره های گیاهی با استفاده از روش های مختلف کروماتوگرافی (ستونی، فلش و لایه نازک)

این آزمایشگاه به دستگاههای زیر مجهز می باشد:

• تنظیم کننده خلاء